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Annals of African Medicine
Annals of African Medicine Society
ISSN: 1596-3519
Vol. 7, No. 4, 2008, pp. 163-167
Bioline Code: am08034
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

Annals of African Medicine, Vol. 7, No. 4, 2008, pp. 163-167

 en Electropherotypes and Subgroups of Group A Rotaviruses Circulating among Diarrhoeic Children in Kano, Nigeria
Dzikwi, A. A.; Umoh, J. U.; Kwaga, J. K. P.; Ahmad, A. A.; de Beer, M. & Steele, A. D.

Abstract

Background: It is estimated that about 600 000 children die annually as a result of severe dehydrating diarrhea caused by rotaviruses. The virus is a double stranded RNA (dsRNA) virus with 11 segments. Group A rotaviruses show a characteristic 4-2-3-2 pattern following electrophoresis. The VP6 subgroups, I and II exist. This work was carried out to study the prevalence of rotavirus infection among children 0-5 years with diarrhea in Kano, and to determine the circulating subgroups and electropherotypes and of the rotavirus isolates.
Methods: Two hundred and eighteen stool specimens from children 0-60 months (198 diarrheic and 20 non-diarrheic) were collected from different hospitals and health care centers in Kano and subjected to group A rotavirus enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) to determine presence of group A rotavirus, subgroup ELISA to determine the VP6 subgroups and polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) to determine the electropherotypes present.
Results: The long electropherotypes (47.05%) of four variations dominated over the short electropherotype (17.64%). About 11.76% of the isolates were of mixed infection. Dominance of subgroup II (45%) over subgroup I (25%), and the presence of both subgroups I and II (10%) and neither subgroup I nor II (15%) was observed in this study. Conclusion: Information on the genomic diversity of the RNA electropherotypes in this region, Kano, is reported in this study.

Keywords
Electropherotypes, Subgroups, Group A, Rotavirus, Nigeria

 
 fr
Dzikwi, A. A.; Umoh, J. U.; Kwaga, J. K. P.; Ahmad, A. A.; de Beer, M. & Steele, A. D.

Résumé

Fond: On l'estime qu'environ 600.000 enfants meurent annuellement en raison de la diarrhée de déshydratation grave provoquée par des rotaviruses. Le virus est un virus bicaténaire d'ARN (dsRNA) avec 11 segments. Groupez l'exposition de rotaviruses d'A un modèle 4-2-3-2 caractéristique après l'électrophorèse. Les sous-groupes VP6, l'I et l'II existent. Ces travaux ont été menés à bien pour étudier la prédominance de l'infection de rotavirus parmi des enfants 0-5 ans avec la diarrhée dans Kano, et pour déterminer les sous-groupes et les electropherotypes de circulation et des isolats de rotavirus.
Méthodes: Deux cents et dix-huit spécimens de selles des enfants 0-60 mois (198 diarrhoeic et 20 non-diarrhoeic) ont été rassemblés de différents hôpitaux et centres de santé dans Kano et soumis au groupe que l'enzyme de rotavirus d'A a lié l'analyse d'immunosorbant (ELISA) pour déterminer la présence du rotavirus du groupe A, ELISA de sous-groupe pour déterminer les sous-groupes VP6 et l'électrophorèse de gel de polyacrylamide (PAGE) pour déterminer les electropherotypes actuels.
Résultats: Les longs electropherotypes (47.05%) de quatre variations ont dominé sur l'electropherotype court (17.64%). Environ 11.76% des isolats étaient de l'infection mélangée. On n'a observé la dominance du sous-groupe d'excédent du sous-groupe II (45%) I (25%), et la présence des deux sous-groupes I et II (10%) et ni sous-groupe I ni II (15%) dans cette étude.
Conclusion: L'information sur la diversité genomic des electropherotypes d'ARN dans cette région, Kano, est rapportée dans cette étude.

Mots Clés
Electropherotypes, sous-groupes, groupent A, Rotavirus, Nigéria

 
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