en

Epidemiology of Rotavirus and Astrovirus Infections in Children in Northwestern Nigeria Aminu, M.; Esona, M. D.; Geyer, A. & Steele, A. D. Abstract Background: Recent estimates attribute 527 000 deaths in children less than five years of age to rotavirus diarrhea annually, with 145 000 occurring in sub-Saharan Africa. Human astroviruses have been identified as one of the most frequent causes of infantile diarrhea, second in incidence only to rotavirus. This study was conducted to determine the prevalence of rotavirus and astrovirus and also to establish the circulating strains of rotavirus in a community in Nigeria where most diarrheic patients do not visit clinics or health care centers. Methods: A total of 154 stool samples (134 diarrheic and 20 non-diarrheic) were collected from infants and young children less than 5 years of age from January-March 2002. Samples were obtained by house-to-house visit in randomly selected districts in Zaria, Northwestern Nigeria. The samples were screened for rotavirus and astrovirus antigens using commercially available Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) kits. All positive group A rotavirus samples were further subjected to VP6 sub-group ELISA, Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) to determine their RNA electropherotypes and Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) to determine their VP7 and VP4 genotypes. Results: Rotavirus and astrovirus antigens were detected in 9% (12) and 5% (7) of the 134 diarrheic stool samples respectively. No viral antigen was detected in the non-diarrheic stools. Rotavirus infection was more common in younger children than astrovirus infection. VP6 sub-group II specificity (58.3%), long RNA electropherotypes (41.6%), VP7 genotype G1 (33.3%) and VP4 genotype P [6] (33.3%) were the most common strains in circulation at that time in the community. Of significance is the fact that a large proportion of the rotavirus strains in circulation could not be assigned either a VP6 sub-group or RNA electrophoretic pattern probably as a result of low viral load. Conclusion: In this community-based study, rotavirus and astrovirus were significantly associated with diarrhea. However, the prevalence of rotavirus infection among children appears to be low while that of astrovirus falls in the range seen in hospital-based studies around the continent. Keywords Rotavirus, astrovirus, diarrhoea, children, community, Nigeria

fr

Aminu, M.; Esona, M. D.; Geyer, A. & Steele, A. D. Résumé Contexte: Des estimations récentes attribuent 527 000 décès annuels d'enfants de moins de 5 ans à la diarrhée par rotavirus, parmi lesquels 145 000 surviennent en Afrique Sub Saharienne. Les astrovirus humains ont été identifiés comme l'une des causes les plus fréquentes de diarrhée infantile, en second lieu viennent les atrovirus. Cette étude a été menée pour déterminer la prévalence des rotavirus et astrovirus et établir les souches circulantes de rotavirus dans une population du Nigéria ou la plupart des patients diarrhéiques ne consultent pas en clinique ni les centres de santé. Méthode: Un total de 154 échantillons de selles (134 diarrhéiques et 20 non-diarrhéiques) ont été collectés chez des enfants de moins de 5 ans de janvier à mars 2002. Les échantillons ont été recueillis par des visites de porte à porte dans des districts de Zaria (Nord-Ouest du Nigéria) sélectionnés par tirage au sort. Les échantillons ont été analysés à la recherche d'antigènes anti rotavirus et astrovirus en utilisant les kits ELISA disponibles dans le commerce. Tous les tests positifs pour identification du groupe A des rotavirus ont été soumis à l'identification par ELISA du sous groupe VP6 ainsi qu'à l'électrophorèse au gel de polyacrylamide pour déterminer leur type électrophorétique d'ARN. La PCR-RT a été utilisée pour déterminer le génotype VP4 et VP7. Résultats: Les antigènes anti rotavirus et astrovirus ont été retrouvés dans respectivement 9% (12) et 5%(7) des 131 échantillons de selles de patients diarrhéiques. Aucun antigène viral n'a été détecté dans les selles non diarrhéiques. L'infection à Rotavirus étaient plus fréquente chez les jeunes enfants que celle à astrovirus. La spécificité du sous-groupe VP6, un long type électrophorétique d'ARN (41,6%) le génotype G1 VP7 (33,3%) et le génotype P [6] VP4 (33,3%) ont été les brins circulants les plus communs a cette période dans la population. L'élément important est le fait que l'importante proportion de rotavirus circulants ne pouvaient être attribué à un sous groupe VP6 ou à un type électrophorétique en raison de la faible charge virale. Conclusion: Dans cette étude, rotavirus et astrovirus étaient significativement associés à la diarrhée. Il apparaît cependant que la prévalence de l'infection à rotavirus parmi les enfants semble faible tandis que celle des astrovirus tombe dans l'intervalle des études conduites dans les hôpitaux sur tout le continent. Mots Clés Rotavirus, astrovirus, diarrhée, enfants, population, Nigeria

© Copyright 2008 - Annals of African Medicine.
Alternative site location: http://www.annalsafrmed.org