Biotecnología Aplicada 1999;16:88-92
Hepatitis C Virus Genotyping in Developing Countries: Results
from Cuba, India and Turkey
Juan Roca, Masood Ahmad, Subrat Kumar Panda, Guillermo Padrón, Shahid Jameel
Code Number: BA99015
ABSTRACT
Infection by hepatitis C virus (HCV) results in liver
disease with a high rate of associated chronicity. Significant
genetic variation is seen among HCV isolates based on nucleotide
sequence homologies, which has allowed grouping into a number of
genotypes. However, most of the information about HCV genotypes is
based on studies from developed countries with less information
available from developing countries. Here we present the results of
HCV genotype determinations in 128 sera from 74 patients in three
countries: Cuba, India and Turkey. An established PCR-based
genotyping method was optimized to accurately detect multiple
genotypes in a given sample. Type II (1b) HCV, which correlates
with more aggressive forms of the disease and lower response rates
to interferon was most commonly found in the patients from the
countries studied. While the majority of patients (58.1%) were
infected with a single genotype, dual infections were also found
frequently (28.4%). This report discusses the utility of a
genotyping assay and the prevalence of genotypes.
Keywords: HCV genotypes, hepatitis C virus, PCR
RESUMEN
La infección por el virus de la
hepatitis C (VHC) causa una enfermedad hepática
caracterizada por una alta tasa de cronicidad. Se han observado
considerables variaciones genéticas entre los diferentes
aislamientos del VHC, basadas en la homología de sus
secuencias nucleotídicas, lo que ha permitido su
agrupamiento en genotipos. No obstante, la mayor parte de la
información sobre los genotipos del VHC se basa en estudios
realizados en países desarrollados, siendo menor la
información procedente de países en desarrollo. En
este trabajo se presentan los resultados de la determinación
de genotipos de pacientes de Cuba, la India y Turquía. Se
estudiaron 128 muestras de suero de 74 pacientes mediante el empleo
de un método ya establecido, basado en reacción en
cadena de la polimerasa, optimizada para detectar con certeza
múltiples genotipos en una muestra. El genotipo del VHC
más frecuentemente encontrado en los pacientes de los tres
países fue el de tipo II (1b), que ha sido asociado con una
enfermedad más agresiva y con menores tasas de respuesta al
interferón. Aunque en la mayoría de los pacientes se
encontró un solo genotipo (58,1%), la infección doble
se observó también con frecuencia (28,4%). Se discute
la utilidad de los ensayos de genotipaje y la prevalencia de los
genotipos.
Palabras claves: genotipos del VHC, RCP, virus
de la hepatitis C
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