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African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730
EISSN: 2072-6589
Vol. 20, No. s1, 2012, pp. 15-30
Bioline Code: cs12010
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

African Crop Science Journal, Vol. 20, No. s1, 2012, pp. 15-30

 en Genetic diversity among farmer-preferred cassava landraces in Uganda
Turyagyenda, L.F.; Kizito, E.B.; Ferguson, M.E.; Baguma, Y.; Harvey, J.W.; Gibson, P.; Wanjala, B.W. & Osiru, D.S.O.

Abstract

Understanding of genetic diversity among a breeding population is an important requirement for crop improvement as it allows for the selection of diverse parental combinations and formation of heterotic pools for genetic gain. This study was carried out to determine genetic diversity within and among 51 farmer-preferred cassava ( Manihot esculenta check for this species in other resources ) landraces and 15 elite accessions grown in Uganda. Twenty six simple sequence repeat (SSR) markers used for genetic diversity assessment in this study revealed a total of 154 alleles, of which 24% were unique alleles present only in landraces. The genetic diversity and observed herozygosity in landraces were slightly higher than in elite accessions. Elite accessions clustered with some of the landraces indicating that there were some alleles in common. However, 58.8% of the landraces fell into 3 different clusters independent of the elite accessions. Including these landraces with unique alleles in cassava breeding schemes will increase the chances of producing farmer preferred adapted elite cultivars. The study also revealed genetic differentiation among accessions from different regions providing an opportunity for establishment of heterotic pools within a breeding programme.

Keywords
Alleles, Manihot esculenta, SSR markers

 
 fr
Turyagyenda, L.F.; Kizito, E.B.; Ferguson, M.E.; Baguma, Y.; Harvey, J.W.; Gibson, P.; Wanjala, B.W. & Osiru, D.S.O.

Résumé

La compréhension de la diversité génétique est une condition importante dans la sélection de diverses combinaisons parentales et la formation des groupes héterotiques d’intérêt génétique pour l’amélioration des cultures. Cette étude était conduite pour déterminer la diversité génétique parmi 51 variétés locales de manioc ( Manihot esculenta check for this species in other resources ) préférées des fermiers et 15 accessions élites cultivées en Ouganda. Vingt six marqueurs simples à sequence répétée (SSR) utilisés pour l’évaluation de la diversité génétique ont révélé un total de 154 allèles, parmi lesquelles 24% étaient des allèles uniques présentes dans les races locales seulement. La diversité génétique et l’héterozygosité observées dans les races locales étaient légèrement supérieures que dans les accessions élites. Celles-ci s’étaient regroupées avec quelques variétés locales indiquant donc qu’elles avaient quelques allèles en commun. Par ailleurs, 58.8% des races locales ont formé trois différents groupes indépendamment des accessions élites. Inclure ces races locales à allèles uniques dans les systèmes d’amélioration du manioc permettra d’augmenter les chances de produire des cultivars élites préférés des fermiers. L’étude montre aussi que la différenciation génétique trouvée parmi les accessions de différentes régions est une opportunité offerte pour l’établissement des groupes héterotiques dans le programme d’amélioration.

Mots Clés
Allèles, Manihot esculenta, marqueurs SSR

 
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