La compréhension de la diversité génétique est une condition importante dans la sélection de diverses combinaisons parentales et la formation des groupes héterotiques d’intérêt génétique pour l’amélioration des cultures. Cette étude était conduite pour déterminer la diversité génétique parmi 51 variétés locales de manioc (
Manihot esculenta
) préférées des fermiers et 15 accessions élites cultivées en Ouganda. Vingt six marqueurs simples à sequence répétée (SSR) utilisés pour l’évaluation de la diversité génétique ont révélé un total de 154 allèles, parmi lesquelles 24% étaient des allèles uniques présentes dans les races locales seulement. La diversité génétique et l’héterozygosité observées dans les races locales étaient légèrement supérieures que dans les accessions élites. Celles-ci s’étaient regroupées avec quelques variétés locales indiquant donc qu’elles avaient quelques allèles en commun. Par ailleurs, 58.8% des races locales ont formé trois différents groupes indépendamment des accessions élites. Inclure ces races locales à allèles uniques dans les systèmes d’amélioration du manioc permettra d’augmenter les chances de produire des cultivars élites préférés des fermiers. L’étude montre aussi que la différenciation génétique trouvée parmi les accessions de différentes régions est une opportunité offerte pour l’établissement des groupes héterotiques dans le programme d’amélioration.