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African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730
EISSN: 2072-6589
Vol. 21, No. 3, 2013, pp. 201-211
Bioline Code: cs13021
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

African Crop Science Journal, Vol. 21, No. 3, 2013, pp. 201-211

 fr GENETIC DIVERSITY OF Fusarium check for this species in other resources WILT RACES OF PIGEONPEA IN MAJOR REGIONS OF INDIA
DATTA, J. & LAL, N.

Résumé

Le Fusarium check for this species in other resources est une sérieuse maladies responsible de la phanaison du pois cajan ( Cajanus cajan check for this species in other resources ) induisant d’importantes pertes de rendements (jusqu’à 90%). La diversité génétique dans le pathogène de phanaison du pois cajan [ Fusarium udum check for this species in other resources (fud)] était caractérisée utilisant 14 isolats collectés dans d’importantes régions indiennes productrices de la culture. Vingt quatre primers RAPD générés d’un total de 226 bandes (variant de 0.3à 3.0 kb) dans F. udum avec une moyenne de 9.4 bandes par primer et un total de 27 allèles étaient produits par douze primers SSR avec une moyenne de 2.25 allèles par marqueurs. Tous les isolats ont amplifié une bande unique variant de 100 à 450 bp. Le primer pair universel IT’S a amplififé 650 bp bandes dans tous les 14 fud isolats, pendant qu’un polymorphisme significatif de taille était seulement obtenu lorsqu’analysé par restriction-digestion avec enzymes EcoRI et Hind III. L’analyse par groupement de ITS-RFLP a groupé tous les 14 Fud isolats en trois groupes majeurs. L’utilisation des marqueurs a permis de montrer strictement le groupement d’isolats de fusarium suivant leurs caractéristiques culturales et degree de pathogénicité et non pas leur origine gvographique. Cette information pourra être aider les pathologists et améliorateurs des cultures à concevoir des programmes d’amélioration effective de résistance dans le pois cajan tenant en compte la diversité dans le pathogène de la phanaison.

Mots Clés
Cajanus cajan; Fusarium; RAPD; SSR

 
 en GENETIC DIVERSITY OF Fusarium check for this species in other resources WILT RACES OF PIGEONPEA IN MAJOR REGIONS OF INDIA
DATTA, J. & LAL, N.

Abstract

Fusarium check for this species in other resources wilt is a serious fungal disease in pigeonpea ( Cajanus cajan check for this species in other resources ) which causes severe yield loses (up to 90%). Genetic diversity in pigeonpea wilt pathogen [ Fusarium udum check for this species in other resources (fud)] was characterised using 14 isolates collected from major pulse growing regions of India. Twenty four RAPD primers generated a total of 226 bands (ranging 0.3 to 3.0 kb) in F. udum with an average of 9.4 bands per primer and a total of 27 alleles were produced by twelve SSR primers with an average of 2.25 alleles per marker. All isolates amplified a single band ranging from 100 to 450 bp. The universal ITS primer pair amplified 650 bp bands in all fourteen fud isolates, while significant length polymorphism was obtained only when analysed by restriction digestion with EcoRI and Hind III enzymes. Cluster analysis of ITS-RFLP grouped all 14 Fud isolates into three major clusters. Cluster analysis using various markers showed the grouping of Fusarium isolates strictly according to their cultural characteristics and degree of pathogenicity and not the geographical origin. This information will be helpful for pathologists and plant breeders to design effective resistance breeding programmes in pigeonpea taking into account the diversity in wilt pathogen.

Keywords
Cajanus cajan; Fusarium; RAPD; SSR

 
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