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African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730
EISSN: 2072-6589
Vol. 22, No. 1, 2014, pp. 45-58
Bioline Code: cs14005
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

African Crop Science Journal, Vol. 22, No. 1, 2014, pp. 45-58

 en GENETIC DIVERSITY AND ECO-GEOGRAPHICAL DISTRIBUTION OF ELEUSINE check for this species in other resources SPECIES COLLECTED FROM ETHIOPIA
Dagnachew, L.; De Villiers, Santie; Sewalem, T.; Dida, M.; Masresha, F.; Kimani, W. & Kassahun, T.

Abstract

Eleusine check for this species in other resources is a small grass genus with three basic chromosome numbers (x=8, 9 and 10) and comprises of eight species including E. coracana check for this species in other resources subsp. coracana, (finger millet), which is an important subsistence crop in Africa and India. Research on these species could assist the development of high yielding and multiple stress tolerant variety(s) of the cultivable species, and also guide development of strategic genetic resource management and utilisation of the genus. A total of 72 accessions, sampled from five major species, E. coracana (including both E. coracana subsp. coracana and E. coracana subsp. africana), E. intermedia, E. indica, E. multiflora and E. floccifolia were analysed for genetic variation and inter-relationships using 20 microsatellite markers. All the SSR markers displayed high genetic polymorphism, with polymorphic information content ranging from 0.46 (UGEP110) to 0.91 (UGEP66). A total of 286 alleles were observed with an average of 14.3 alleles per locus. Classic F-statistics revealed the highest intra-specific polymorphism recorded for E. africana (32.45%), followed by E. coracana (16.83%); implying that genetic polymorphism is higher in the cultivable subspecies and its wild relatives, than the other species. Allelic frequency based inter-species genetic distance analysis, showed wider genetic distance between E. indica and E. multiflora (0.719); a narrow genetic distance between E. coracana sub-species africana and E. coracana subspecies coracana (0.3297). The weighted neighbor joining-based clustering revealed that the majority of the accessions in a species share strong similarity and are grouped together than do accessions of inter species.

Keywords
Eleusine; microsatellite; polymorphism

 
 fr
Dagnachew, L.; De Villiers, Santie; Sewalem, T.; Dida, M.; Masresha, F.; Kimani, W. & Kassahun, T.

Résumé

Eleusine check for this species in other resources est une herbe avec trois nombres de chromosomes de base (x=8, 9 et 10) et comprend huit espèces dont E. coracana subsp. coracana, (finger millet), qui est une culture de subsistence importante en Afrique et en Inde. La recherche sur ces espèces pourrait aider dans le développement des variétés d’espèces cultivables à rendement élevé et de tolérance aux stress multiples, et guider le développement de la gestion des ressources génétiques stratégiques et l’utilisation du genus. Un total de 72 accessions échantillonnées de cinq espèces majeurs à savoir E. coracana (incluant E. coracana subsp. coracana et E. coracana subsp. africana), E. intermedia, E. indica, E. multiflora et E. floccifolia étaient analysées pour variation génétique et relations mutuelles utilisant 20 marqueurs microsatellites. Tous les marquers SSR ont manifesté un polymorphisme génétique élevé, avec un contenu d’information polymorphique allant de 0.46 (UGEP110) à 0.91 (UGEP66). Un total de 286 allèles était observé avec une moyenne de 14.3 allèles par locus. Les statistiqies classiques F ont révélé le polymorphisme intraspécifique le plus élevé enregistré pour le E. africana (32.45%), suivi de E. coracana (16.83%), ce qui implique que le polymorphisme génétique est le plus élevé dans les sous espèces cultivables et ses homologues sauvages que les autres espèces. L’analyse de la fréquence allélique de la distance génétique entre espèces a montré une plus large distance génétique entre E. indica et E. multiflora (0.719); une étroite distance génétique entre les sous espèces Africana de E. coracana et les sous espèces coracana de E. coracana (0.3297). La pondération des groupements a révélé que la majorité des accessions au sein d’une espèce partage une forte similarité et sont groupées ensemble en comparaison aux accessions des intra-espèces.

Mots Clés
Eleusine; microsatellite; polymorphisme

 
© African Crop Science Journal

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