search
for
 About Bioline  All Journals  Testimonials  Membership  News  Donations


African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730
EISSN: 2072-6589
Vol. 23, No. 1, 2015, pp. 45-57
Bioline Code: cs15005
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

African Crop Science Journal, Vol. 23, No. 1, 2015, pp. 45-57

 en DYNAMICS OF Cercospora zeina check for this species in other resources POPULATIONS IN MAIZE-BASED AGRO-ECOLOGIES OF UGANDA
OKORI, P.; RUBAIHAYO, P.R.; ADIPALA, E.; FAHIESON, J. & DIXELIUS, C.

Abstract

Stability of pathogen populations characterised by slow temporal variation is important for durability of disease management systems in any agroecology. Temporal variation in population structure is attributed to factors related to ecology, biology and life history, and varies among organisms and ecosystems. The objective of this study was to investigate genetic variability of Cercospora zeina check for this species in other resources (previously called Cercospora zeae-maydis check for this species in other resources Type II) populations in maize ( Zea mays check for this species in other resources ) producing areas under Uganda conditions. Populations of the fungus were analysed for genetic variability using a fluorescent amplified fragment length polymorphism (AFLP) technique. Little or no genetic differentiation (ΦFST 0.05) was detected for populations sampled within the same year, within an agroecology. However, a weak to moderate population structure was detected between populations from different locations, within the same (ΦFST = 0.08) or different agroecologies (ΦFST = 0.09). Pair-wise comparisons using ΦFST gene diversity and genetic distance, showed a reduction in genetic diversity in younger populations, suggestive of minor effects of selection and genetic drift. Overall, the data suggest that during the 3 years of study the impact of selection and genetic drift on C. zeina populations in the two Ugandan agroecologies is slow, but progressive leading to homogenetity with agroecologies and differences between agroecologies.

Keywords
Cercospora zeae-maydis; Cercospora zeina; genetic; structure; Zea mays

 
 fr DYNAMICS OF Cercospora zeina check for this species in other resources POPULATIONS IN MAIZE-BASED AGRO-ECOLOGIES OF UGANDA
OKORI, P.; RUBAIHAYO, P.R.; ADIPALA, E.; FAHIESON, J. & DIXELIUS, C.

Résumé

La stabilité des populations d’agents pathogènes caractérisée par une faible variation dans le temps, est importante pour la durabilité dans les systèmes de gestion des pathologies des plantes dans n’importe quelle zone agro-écologique. La variation dans le temps au sein d’une population, est fonction de facteurs relatifs à l’écologie, la biologie et l’histoire de vie des pathogènes. Elle varie d’un être vivant à un autre et d’un écosystème à un autre. L’objectif de cette étude était d’évaluer la variabilité génétique au sein des populations de Cercospora zeina check for this species in other resources (précedemment appelé Cercospora zeae-maydis check for this species in other resources Type II) dans les zones productrice de maïs ( Zea mays check for this species in other resources ) en Ouganda. Les populations de ce champignon microscopique ont été soumises à une étude de variabilité génétique grâce à la technique du polymorphisme de longueur de fragments amplifiés (AFLP). Très peu ou aucune variation génétique (ΦFST 0.05) n’a été observée pour les populations échantillonnées au cours de la même année, dans une zone agro-écologique donnée. Néanmoins, une structure populationnelle d’envergure faible à modérée a été observée entre les populations de différentes origines, (ΦFST = 0.08) à l’intérieur d’une même population ou (ΦFST = 0.09) entre les populations de différente zones agro écologique. La comparaison par paires utilisant ΦFST diversité des gènes et distance génétique, a montré une réduction de diversité génétique dans les populations les plus jeunes, suggérant ainsi un effet mineur de sélection et de dérive génétique. Au total, les données collectées indiquent un faible impact de sélection et de dérive génétique sur les populations de C. zeina dans les deux zones agro-écologiques Ougandaise durant les 3 années de l’étude, mais cet impact est progressif et responsable de l’homogénéité au sein des zones agro-écologiques et des différences entre les zones agro-écologiques.

Mots Clés
Cercospora zeae-maydis; Cercospora zeina; génétique; structure; Zea mays

 
© Copyright 2015 - African Crop Science Journal

Home Faq Resources Email Bioline
© Bioline International, 1989 - 2022, Site last up-dated on 10-Dec-2021.
Site created and maintained by the Reference Center on Environmental Information, CRIA, Brazil
System hosted by the Internet Data Center of Rede Nacional de Ensino e Pesquisa, RNP, Brazil