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African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730
EISSN: 1021-9730
Vol. 24, No. s1, 2016, pp. 11-24
Bioline Code: cs16010
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

African Crop Science Journal, Vol. 24, No. s1, 2016, pp. 11-24

 fr
Lussewa, R.K.; Edema, R. & Lamo, J.

Résumé

La brûlure foliaire bactérienne (BLB) est causée chez le riz ( Oryzae sativa check for this species in other resources L.) par Xanthomonas oryzae check for this species in other resources pv. oryzae qui est un problème majeur dans la plupart des basfonds ou on produit le riz en Ouganda. La maladie est largement répandue dans tous les écosystèmes ou le riz est produit, soit par irrigation ou par les pluies. L’agent pathogène (Xoo) présente une très grande diversification, et très difficile a Controller. Le développement et déploiement d’hôtes résistants est le seul moyen efficace pour le control du BLB. La présente étude visait à déterminer l’effet de l’interaction génotype-environnement (GxE) sur la résistance à la bactérie de brulure foliaire chez le riz en Ouganda. Une expérimentation a été conduite sur 30 génotypes de riz, dont 13 lignées avec des niveaux de résistance variés à BLB et 17 lignées F4 générées en croissant 7 lignées parentales dont les F1 ont été avances a Namulonge-Wakiso, Olweny-Lira et Kibimba- Bugiri en Ouganda. L’étude a aussi pris en compte 7 lignées parentales et 6 variétés populaires utilisées dans la plupart des champs. La variété IR 24 a été utilisée comme référence universelle résistante au BLB dans les populations de riz asiatiques. Les résultats ont révélé des réactions diverses sur une série de lignées isogéniques par rapport à IR24, et quelques accessions nationales et régionales. IRBB1 (Xa1), IRBB2 (Xa2) et IRBB14 (Xa14) se sont montre peu ou très susceptibles au BLB dans les trois localités. Tandis que le génotype IRBB4 qui porte le gène Xa4 a réagi de façon différente vis à vis des pathotypes de Kibimba et de Lira compare à ceux de Namulonge, IRBB10 (Xa10) et IRBB11 (Xa11) ont différencié les pathotypes de Lira par rapport au reste. Les génotypes portant des cumuls de gènes de résistance ont exhibes des réactions identiques dans toutes les trois populations. Généralement, les lignées presque isogéniques IRBB1, IRBB2, IRBB11 et IRBB14, ont présenté les pourcentages les plus élevés de dommages foliaires. Les dommages les plus importants étaient observés chez IRBB11 en contact avec les pathotypes de Kibimba, pour lesquels on a noté 43% d’attaque foliaire. Dans toutes les localités, les dégâts étaient modérés sur les génotypes à plusieurs gènes de résistance et deux avec un seul gène. Par exemple, IRBB8 et IRBB21, respectivement. Fort heureusement, IR24 était autant résistant que tous les autres gènes cumulés. Il a été aussi observe que les réactions sur les génotypes testes varient d’une location a une autre. L’analyse de variance par AMMI a partitionne les effets des traitements en effet dus aux génotypes, a l’environnement et a leur interaction. Aussi, il a été observe que les sommes des carrés moyens due au traitements, génotypes, environnement et interaction génotype-environnement, étaient significatives et contribuent respectivement 48.2, 15.3, 19.3 et 13.3% a la variation totale. L’axe PCA1 a expliqué 73.02% de la variation totale due à l’interaction G x E.

Mots Clés
Oryzae sativa; pyramide; Xanthomonas

 
 en Magnitude of genotype x environment interaction for bacterial leaf blight resistance in rice growing areas of Uganda
Lussewa, R.K.; Edema, R. & Lamo, J.

Abstract

Bacterial leaf blight (BLB) of rice ( Oryzae sativa check for this species in other resources L.), caused by Xanthomonas oryzae check for this species in other resources pv. oryzae, is a major constraint in most lowland rice producing areas of Uganda. The disease is widely distributed in all irrigated and rainfed lowland rice ecosytems in the country. The pathogen (Xoo) is highly variable and its control is rather difficult. Development and deployment of host resistance is the only effective means of BLB management. The objective of this study was to determine the magnitude of genotype by environment (G x E) interaction for resistance to bacterial leaf blight in rice in Uganda. A study comprised of two sets of germplasms, a total of 30 rice genotypes comprising of 13 lines with varying levels of BLB resistance, and 17 F4 lines that had been previous generated through crossing 7 parental lines, and then advanced in bulk from F1, was conducted in Namulonge-Wakiso, Olweny-Lira and Kibimba- Bugiri districts in Uganda. The study also included 7 parental lines and 6 popular varieties used in most farmers’ fields. Variety IR 24 had been used as a universal check against BLB in Asian rice populations. Results revealed differential reactions on a set of near isogenic lines in the background of IR24, and some national and regional cultivars. IRBB1 (Xa1), IRBB2 (Xa2) and IRBB14 (Xa14) showed moderate susceptibility to susceptibility towards field pathogen populations in the three locations. Whereas genotype IRBB4 with gene Xa4 differentiated pathotypes of Kibimba and Lira from that of Namulonge, IRBB10 (Xa10) and IRBB11 (Xa11) differentiated pathotypes of Lira from the rest. Genotypes that had been pyramided with BLB genes of resistance, showed similar reactions to the three field populations. Generally, the near isogenic lines IRBB1, IRBB2, IRBB11 and IRBB14, had the highest leaf area damaged by disease attack. The highest was shown by IRBB11 with the Kibimba pathotypes for which disease attack was 43%. Low attack was observed on pyramided genotypes in all locations and two with single gene, i.e. IRBB8 and IRBB21, respectively. Interestingly, IR24 was as resistant as any of the pyramided combinations. Results also revealed different reactions of the tested genotypes in the three locations. The analysis of variance by AMMI partitioned the main effects of treatments into genotype, environment, and genotype x environment (G x E) interactions. Results also revealed that, the mean sum of squares due to treatments, genotypes, environments and genotype x environment interaction were significant, and contributed 48.2, 15.3, 19.3 and 13.3%, respectively, PCA1 accounted for 73.02% of the total G x E sum of squares.

Keywords
Oryzae sativa; pyramid; Xanthomonas

 
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