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African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730
EISSN: 1021-9730
Vol. 26, No. 1, 2018, pp. 37-48
Bioline Code: cs18003
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

African Crop Science Journal, Vol. 26, No. 1, 2018, pp. 37-48

 fr
Sseremba, G.; Tongoona, P.; Eleblu, J.S.Y.; Danquah, E.Y. & Kizito, E.B.

Résumé

L’aubergine Africaine ( Solanum aethiopicum check for this species in other resources ) demeure en arrière en termes de travaux de recherches ; conduisant à, entre autres lacunes, manque d’information sur la diversité génétique intra-groupe. La classification hiérarchique était utilisée pour révéler la structure dans une série de 20 accessions de groupe Shum de S. aethiopicum au secrétariat du Réseau Africain de Recherches sur les Solanaceae utilisant 61 variables morpho-agronomiques collectées d’un design complet aléatoire (CRD) avec 12 plantes par accession sous la serre. Une MANOVA a précédé l’analyse discriminante linéaire, pour modéliser chacune des 61 variables, comme prédit par les classes et l’expérimentation pour filtrer les traits non-significatifs. Quatre différentes classes ont été identifiées, avec un coefficient de relation cophénétique de 0,87 (P<0,01). Les variables canoniques qui ont mieux prédit les classes observées comprenaient la longueur du pétiole, la longueur du sépale (ou la couleur des graines), la longueur du calice du fruit, le nombre de graines par fruit, le poids de feuilles fraîches (ou feuilles par plante), le poids du fruit non sec, la vigueur des plantules, le nombre de fruits par plante, l’indice de récolte et l’habitude de croissance du plant. Les résultats ont suggéré une discrimination de la variété à divers stades, semis, végétatif et reproductif. La diversité observée va augmenter les chances pour une sélection effective des traits désirés ; alors que les traits discriminants canoniques sont les marqueurs morphologiques, parmi le S. aethiopicum de type ‘Shum’ pour une approche de caractérisation à moindre coût du germplasm.

Mots Clés
Classification hiérarchique; marqueurs morphologiques; Solanum aethiopicum

 
 en Linear discriminant analysis of structure within African eggplant ‘Shum’
Sseremba, G.; Tongoona, P.; Eleblu, J.S.Y.; Danquah, E.Y. & Kizito, E.B.

Abstract

African eggplant ( Solanum aethiopicum check for this species in other resources ) lags behind in terms of research attention; leading to, among other gaps, scantiness of information on intra-group genetic diversity. Hierarchical clustering was applied to reveal structure in a pioneer 20-entry set of S. aethiopicum Shum group accessions at Africa Solanaceae Research Network secretariat in Uganda, using 61 morpho-agronomic variables collected from a complete randomised design (CRD) with 12 plants per accession in screen-house. A MANOVA preceded linear discriminant analysis, to model each of 61 variables, as predicted by clusters and experiment to filter out non-significant traits. Four distinct clusters emerged, with a cophenetic relation coefficient of 0.87 (P<0.01). Canonical variates that best predicted the observed clusters include petiole length, sepal length (or seed color), fruit calyx length, seeds per fruit, leaf fresh weight (or leaves per plant), fruit fresh yield, seedling vigour, fruits per plant, harvest index and plant growth habit. Results suggest prospects for variety discrimination at various stages; seedling, vegetative and reproductive. The observed diversity will boost chances of effective selection for desired traits; while the canonical discriminant traits are potential morphological markers, within S. aethiopicum ‘Shum’ for a low-cost germplasm characterisation approach.

Keywords
Hierarchical clustering; morphological markers; Solanum aethiopicum

 
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