Les fonios (
Digitaria exilis
Kipps. et
D. iburua
Stapf) sont des cultures alimentaires très importantes en Afrique de l’Ouest. Malgré les différentes potentialités économiques de cette culture, très peu ou aucune attention n’est portée sur l’évaluation et l’amélioration de son germplasm. Dans cette étude, nous avions évalué la diversité génétique et la relation entre les génotypes cultivés du fonio au Nigéria, en utilisant les markers Inter-Simple SequenceRepeat (IISSR) pour la première fois. Les ADN génomiques étaient extraits des génotypes et nous avions utilisé la technologie de Réaction en Chaîne de la Polymérase (PCR). Un total de 95 loci contenant 790 bands étaient amplifiées par 13 amorces d’ISSR, sur lesquelles 53,37% étaient polymorphiques. L’amplification des loci par amorces variait de 5 à 10, avec une moyenne de 7.30 loci per amorce. Huit des amorces ont plus de 50% de polymorphisme. L’analyse typologique a séparé les génotypes en deux grands groupes ; un groupe comportant deux génotypes de
D. exilis et les autres comprennent un mélange de génotypes. Les
D. exilis dans le dernier groupe étaient membres distants et étaient le seul similaire à 0,72 d’indice de similarité. Le polymorphisme que nous avons obtenu dans cette étude a montré que les markers ISSR sont efficaces pour l’évaluation de la diversité génétique des génotypes. Le regroupement de
D. exilis et
D. iburua ensemble suggère un parent commun mais pourrait être séparé par le mécanisme d’isolement géographique.