L’apparition de CABMV sur le niébé (
Vigna unguiculata
(L.)) en Ouganda a été décrite récemment dans plusieurs études. Cette étude a développé et optimisé un essai basé sur la transcription inverse- réaction en chaîne par polymérase (RT-PCR) pour la détection du CABMV dans les échantillons de feuilles, et la comparé aux essais précédents basés sur la RT-PCR et ELISA. L’usage de l’amorce direct (CABFF1, 5'- GGT AAC AAY AGT GGR CAA CC-3’) et d’amorce réverse (CABRR1, 5'- CTG AGC ACT CMA ACC GGG-3') a donné ~ 1,642 bp. Le séquençage d’amplicon et l’analyse subséquente de BLASTN ont montré que les isolats d’Ouganda étaient à 89,3-94,3% identiques indiquant qu’ils appartiennent à la même souche de CABMV. Les analyses phylogénétiques ont aussi placé les isolats Ougandais dans la même classe qui est différente des autres isolats mais proche de ceux du Burkina-Faso. Néanmoins, les essais de RT-PCR (GF/GR paire d’amorces) précédents n’ont pas donné les fragments PCR espérés (221 bp) et n’ont donné aucune détection de virus à partir du séquençage d’amplicon et de l’analyse de la séquence. L’essai de l’ELISA n’a pas différencié entre les échantillons positifs et négatifs. L’essai RT-PCR nouvellement développé pour détecter le CABMV, décrit dans cette étude, a d’importantes applications pour la mise en quarantaine de la plante, sélection pour la résistance, les études des gammes d’hôtes ainsi que les études épidémiologiques pour le contrôle du CABMV dans le pays.