search
for
 About Bioline  All Journals  Testimonials  Membership  News  Donations


African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730
EISSN: 1021-9730
Vol. 28, No. 2, 2020, pp. 241-254
Bioline Code: cs20019
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

African Crop Science Journal, Vol. 28, No. 2, 2020, pp. 241-254

 en Allelic variations in aroma gene in cultivated rice varieties
Akwero, A.; Ocan, D.; Akech, W.; Lamo, J.; Ochwo-Ssemakula, M. & Rubaihayo, P.

Abstract

Germplasm is a valuable source of genetic diversity that supports crop improvement efforts in any breeding programme but it must first be fully characterised for economically valuable traits before it can be effectively utilised. In rice ( Oryza sativa check for this species in other resources ), the development of new varieties with improved aroma requires correct phenotyping and prior knowledge of the available genes and alleles governing the aroma trait in the gene pool. Correct phenotyping and genotyping can be achieved using sensory methods and functional markers associated with polymorphisms that define the aroma genes. The objective of this study was to evaluate the aroma status of rice accessions and to assess for the various alleles of badh2 gene using functional markers. A total of 56 rice accessions were evaluated at National Crops Resources Research Institute (NaCRRI) in Uganda for their aroma using sensory methods and a molecular marker to differentiate between aromatic and non- aromatic accessions. The aromatic accessions were then evaluated for variations within the betaine aldehyde dehydrogenase2 (badh2) gene responsible for aroma in rice using functional markers. Sensory evaluation of aroma identified 23 accessions to be aromatic; while 33 were non-aromatic. Molecular results identified 20 accessions as aromatic; while 36 accessions were non-aromatic. Functional marker analysis indicated the presence of badh2-E7 allele in 20 aromatic accessions within this collection that could be employed in the breeding programme for the rice aromatic trait.

Keywords
badh2 alleles; functional markers; Oryza sativa

 
 fr
Akwero, A.; Ocan, D.; Akech, W.; Lamo, J.; Ochwo-Ssemakula, M. & Rubaihayo, P.

Résumé

Le germoplasme est une source précieuse de diversité génétique qui soutient les efforts d’amélioration des cultures dans tout programme de sélection, mais il doit d’abord être entièrement caractérisé pour ses traits économiquement précieux avant de pouvoir être utilisé efficacement. Dans le riz ( Oryza sativa check for this species in other resources ), le développement de nouvelles variétés avec un arôme amélioré nécessite un phénotypage correct et une connaissance préalable des gènes et allèles disponibles régissant le caractère aromatique dans le pool génétique. Un phénotypage et un génotypage corrects peuvent être obtenus en utilisant des méthodes sensorielles et des marqueurs fonctionnels associés à des polymorphismes qui définissent les gènes aromatiques. L’objectif de cette étude était d’évaluer le statut aromatique des accessions de riz et d’évaluer les différents allèles du gène badh2 à l’aide de marqueurs fonctionnels. Un total de 56 accessions de riz ont été évaluées au National Crops Resources Research Institute (NaCRRI) en Ouganda pour leur arôme en utilisant des méthodes sensorielles et un marqueur moléculaire pour différencier les accessions aromatiques et non aromatiques. Les accessions aromatiques ont ensuite été évaluées pour les variations au sein du gène de la bétaïne aldéhyde déshydrogénase2 (badh2) responsable de l’arôme du riz à l’aide de marqueurs fonctionnels. L’évaluation sensorielle de l’arôme a identifié 23 accessions comme aromatiques; tandis que 33 étaient non aromatiques. Les résultats moléculaires ont identifié 20 accessions comme aromatiques; tandis que 36 accessions n’étaient pas aromatiques. L’analyse des marqueurs fonctionnels a indiqué la présence d’allèles badh2-E7 dans 20 accessions aromatiques de cette collection qui pourraient être utilisées dans le programme de sélection pour le trait aromatique du riz.

Mots Clés
badh2 alleles; Marqueurs fonctionnels; Oryza sativa

 
© Copyright 2020 - African Crop Science Society

Home Faq Resources Email Bioline
© Bioline International, 1989 - 2022, Site last up-dated on 27-Jul-2022.
Site created and maintained by the Reference Center on Environmental Information, CRIA, Brazil
System hosted by the Internet Data Center of Rede Nacional de Ensino e Pesquisa, RNP, Brazil