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African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730
EISSN: 2072-6589
Vol. 28, No. 4, 2020, pp. 555-566
Bioline Code: cs20062
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

African Crop Science Journal, Vol. 28, No. 4, 2020, pp. 555-566

 fr
Goredema, N.; Ndowora, T.; Shoko, R. & Ngadze, E.

Résumé

Les espèces de Streptomyces check for this species in other resources sont des bactéries aérobies et chimio-organotrophes. Ces micro-organismes produisent une large gamme de composés d’importance industrielle, en particulier des antibiotiques et des substances antifongiques. L’objectif de cette étude était de caractériser les isolats de Streptomyces transmis par le sol à l’aide de traits morphologiques et moléculaires afin de les identifier au niveau de l’espèce, et de tirer parti de leur potentiel à supprimer la croissance d’ Aspergillus flavus check for this species in other resources , Fusarium oxysporum check for this species in other resources et Penicillium italicum check for this species in other resources . Vingt-sept Streptomyces putatifs transmis par le sol, qui ont suscité une activité antimicrobienne complète contre Aspergillus flavus, Fusarium oxysporum et Penicillium italicum, dans une étude précédente, ont été évalués. Sur la base de la morphologie, les bactéries ressemblaient au genre Streptomyces. Au départ, les colonies semblaient phénotypiquement avoir une surface relativement lisse, mais au fur et à mesure que la croissance progressait, les bactéries développaient une trame de mycélium aérien d’aspect granuleux, poudreux ou velouté. Les bactéries produisaient une grande variété de pigments qui à leur tour étaient responsables de la couleur des mycéliums végétatifs et aériens, la couleur variait du blanc au crème ou au chamois et du jaune à l’orange ou au brun. Des analyses microscopiques et des caractéristiques morphologiques ont généré des sous-groupes d’isolats et les ont regroupés en fonction de leurs similitudes. Une souche bactérienne a été sélectionnée au hasard dans chaque groupe et étudiée en utilisant des caractéristiques moléculaires. Des ADNr 16S partiels provenant des isolats représentatifs sélectionnés de chaque sous-groupe ont été séquencés et une analyse phylogénétique a été effectuée. Les séquences d’ADNr 16S des isolats ont indiqué qu’ils étaient apparentés aux espèces de Streptomyces: S. bungoensis check for this species in other resources , S. thermocarboxydus check for this species in other resources , S. corchorusii check for this species in other resources et S. lasaliensis, qui sont des producteurs de métabolites secondaires connus possédant une activité antimicrobienne contre les phytopathogènes.

Mots Clés
activité antimicrobienne; analyse phylogénétique; métabolites secondaires

 
 en Morphological and molecular characterisation of Streptomyces check for this species in other resources spp. which suppress pathogenic fungi
Goredema, N.; Ndowora, T.; Shoko, R. & Ngadze, E.

Abstract

Streptomyces species are aerobes and chemoorganotrophic bacteria. These microorganisms produce a wide range of industrially significant compounds, specifically antibiotics and anti fungal substances. The objective of this study was to characterise soil-borne Streptomyces isolates using morphological and molecular traits in order to identify them to species level, and leverage from their potential to suppress the growth of Aspergillus flavus check for this species in other resources , Fusarium oxysporum check for this species in other resources and Penicillium italicum check for this species in other resources . Twenty-seven soil-borne putative Streptomyces, which elicited comprehensive antimicrobial activity against Aspergillus flavus, Fusarium oxysporum and Penicillium italicum, in a previous study, were evaluated. On the basis of morphology, the bacteria resembled the genus Streptomyces. Initially, colonies phenotypically appeared to have a relatively smooth surface but as growth progressed the bacteria developed a weft of aerial mycelium granular, powdery or velvety in appearance. Bacteria produced a wide variety of pigments which in turn were responsible for the colour of the vegetative and aerial mycelia, colour ranged from white to cream or buff shades and yellow to orange or brown. Microscopic analyses and morphological characteristics generated sub-groups of the isolates and clustered them according to their similarities. One bacterial strain was randomly selected from each cluster and investigated using molecular characteristics. Partial 16S rDNAs from the selected representative isolates from each subgroup, were sequenced and phylogenetic analysis performed. The 16S rDNA sequences of the isolates indicated that they were related to  Streptomyces species: S. bungoensis check for this species in other resources , S. thermocarboxydus check for this species in other resources , S. corchorusii check for this species in other resources and S. lasaliensis, that are known secondary metabolite producers possessing antimicrobial activity against plant pathogens.

Keywords
Antimicrobial activity; phylogenetic analysis; secondary metabolites

 
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