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African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730
EISSN: 2072-6589
Vol. 29, No. 1, 2021, pp. 77-99
Bioline Code: cs21006
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

African Crop Science Journal, Vol. 29, No. 1, 2021, pp. 77-99

 en Distribution of potato viruses in Uganda
Byarugaba, A.A.; Mukasa, S.B.; Barekye, A. & Rubaihayo, P.R.

Abstract

Viral diseases are among the major factors affecting potato ( Solanum tuberosum check for this species in other resources L.) production in Uganda. Knowledge of the types of viruses and their distribution levels in the country is vital for targeting sound management strategies. The objective of this study was to assess the prevalence and distribution of potato viruses in different potato growing areas in Uganda. Virus diagnostic surveys were conducted across the main potato producing regions and virus detection was done using DAS-ELISA and RT-PCR techniques. The study showed that the most widely distributed and economically important potato viruses were: PVS (31-90.9%), PLRV (2.6-81.3%), PVY (7.1-54.5%) and PVX (8.3 -53.3%); while the least detected viruses were PVM (18.2%) and PVA (9%). The viruses were prevalent either singly or in mixtures. Up to 42.8% of the samples were infected with one virus, 20.9% with two viruses and 4.2% with three viruses; while no virus was detected in 31.3% of the samples. Of the double infections, the PVY+PVS combination was the most common and widely distributed (2.1-18.2%) in 12 districts; followed by PVY+PLRV (1.8-21.3%) occurring in six districts, PVM+PVS (7.9-16.7%), PLRV+PVX (2.4-14.3%) in 5 districts and PVY+PVX (2.4-4.4%) in 3 districts. Triple infections involving PVY+PLRV+PVS were recorded at prevalence levels of 2.2-18.6% in six district. Altitude, temperature, varieties and seed sources showed relationships with the variation in the prevalence of the viruses. There were high virus prevalence and disease severity levels in low altitude areas (1088-1334 m.a.s.l) of mid-western sub-region (Mbarara and Lwengo), Central (Kibaale, Mubende) and Mid Northern (Pader) sub region compared to high altitude areas (>1600 m.a.s.l). The Virus risk Area Modeling results showed the largest area (48.6%; 1,308,160 ha) at moderate risk of virus infection; while 27.3% (732,305 ha) was at high risk of virus infection. Based on the distribution level of the viruses, potato production could be intensified in areas with less virus pressure mainly, in parts of West Nile and Rwenzori regions.

Keywords
DAS-ELISA; Solanum tuberosum

 
 fr
Byarugaba, A.A.; Mukasa, S.B.; Barekye, A. & Rubaihayo, P.R.

Résumé

Les maladies virales sont l’un des principaux facteurs affectant la production de pommes de terre ( Solanum tuberosum check for this species in other resources L.) en Ouganda. La connaissance des types de virus et de leurs niveaux de distribution en Ouganda est essentielle pour cibler des stratégies de gestion rationnelles. L’objectif de cette étude était d’évaluer la prévalence et la distribution des virus de la pomme de terre dans différentes zones de culture de la pomme de terre en Ouganda. Des enquêtes de diagnostic viral ont été menées dans les principales régions productrices de pommes de terre et la détection des virus a été effectuée à l’aide des techniques DAS-ELISA et RT-PCR. L’étude a montré que les virus de la pomme de terre les plus largement répandus et les plus importants sur le plan économique étaient: PVS (31-90,9%), PLRV (2,6-81,3%), PVY (7,1-54,5%) et PVX (8,3% -53,3%); tandis que les virus les moins détectés étaient le PVM (18,2%) et le PVA (9%). Ces virus étaient répandus seuls ou en mélanges. Jusqu’à 42,8% des échantillons étaient infectés par un virus, 20,9% par deux virus et 4,2% par trois virus; alors qu’aucun virus n’a été détecté dans 31,3% des échantillons. Parmi les doubles infections, la combinaison PVY + PVS était la plus courante et la plus répandue (2,1 à 18,2%) dans 12 districts; suivi de PVY + PLRV (1,8-21,3%) survenant dans six districts, PVM + PVS (7,9-16,7%), PLRV + PVX (2,4-14,3%) dans 5 districts et PVY + PVX (2,4-4,4%) dans 3 les quartiers. Des infections triples impliquant PVY + PLRV + PVS ont été enregistrées à un niveau de prévalence de 2,2 à 18,6% dans six districts. L’altitude, la température, les variétés et les sources de semences ont montré une relation avec la variation de la prévalence des virus. La prévalence du virus et la gravité de la maladie virale étaient élevées dans les zones de basse altitude (1088-1334 m d’altitude) de la sous-région du centre-ouest (Mbarara et Lwengo), du centre (Kibaale, Mubende) et du centre-nord (Pader) par rapport aux zones de haute altitude (> 1600 m d’altitude). Les résultats de la modélisation des zones à risque viral ont montré que la plus grande zone (48,6%; 1 308 160 ha) présente un risque modéré d’infection virale; tandis que 27,3% (732 305 ha) étaient à haut risque d’infection virale. Sur la base du niveau de distribution des virus, la production de pommes de terre pourrait être intensifiée dans les zones où la pression virale est moindre, principalement dans certaines parties des régions du Nil occidental et de Rwenzori.

Mots Clés
DAS-ELISA; Solanum tuberosum

 
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