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African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730
EISSN: 1021-9730
Vol. 29, No. 3, 2021, pp. 383-400
Bioline Code: cs21025
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

African Crop Science Journal, Vol. 29, No. 3, 2021, pp. 383-400

 fr
Ramathani, I.; Mukasa, S.B.; Alicai, T.; Nanyiti, S. & Lamo, J.

Résumé

La production de riz ( Oryza check for this species in other resources spp ; 2n=24.) en Ouganda et en Afrique en général, est sérieusement menacée par la maladie du virus de la marbrure jaune du riz (RYMVD), une maladie causée par le virus de la marbrure jaune du riz (RYMV) du genre Sobemovirus ; famille des Sobemoviridae. Cette étude a examiné l’existence et la distribution du pathotype RYMV qui brise la résistance dans les trois principaux bassins versants de riz de plaine en Ouganda. Les quatre accessions de riz connues résistantes au  virus de la panachure jaune du riz (RYMV, Rice yellow mottle virus) à savoir; Gigante, Tog5672, Tog5674 et Tog5681, portant respectivement les allèles résistants rymv1-2, rymv1-4 & rymv3, rymv1-5 et rymv1-3, ont été testés pour leur réponse à différents isolats de RYMV. Les isolats ont été collectés dans les trois principaux bassins versants du riz de plaine de Doho, Kibimba et Olweny en Ouganda. Sur les 100 échantillons des feuilles prélevés sur le terrain et testés pour le RYMV et confirmés positifs par RT-PCR, 83 isolats ont induit des symptômes sur IR64, la lignée sensible au RYMV. Les soixante-dix-sept (92,8 %) isolats ont réussi à surmonter la résistance dans au moins une des quatre accessions du riz différentielles, comme le confirme la présence des symptômes du RYMV ; tandis que 6 (7,2 %) isolats étaient asymptomatiques. Une variation dans le temps (jours) pour le développement des symptômes après l’inoculation (dpi, development post-inoculation) et l’AUDPC a été observée. Les symptômes sont apparus dans les 5 à 7 jours sur IR64 ; alors qu’il a fallu en moyenne 11, 18, 36 et 18 jours pour apparaître sur Gigante, Tog5672, Tog5674 et Tog5681, respectivement. L’AUDPC le plus élevé a été observé sur IR64 (254,7); tandis que l’AUDPC le plus bas a été observé sur Tog5681 (74,1). Deux patho-groupes principaux ont été observés; ceux qui ont brisé la résistance dans les Gigante uniquement (25,3%) et Gigante & Tog5672 (33,7%). Les cinq isolats des bassins versants de Doho (districts de Budaka et Bugiri) et de Kibimba (district de Butaleja) ont brisé la résistance au RYMV dans trois accessions, à savoir (Tog5681, Gigante et Tog5672) et (Tog5674, Gigante et Tog5672), respectivement. Des isolats brisant la résistance ont été confirmés dans les trois zones de captage échantillonnées, cependant, Doho et Kibimba avaient des isolats uniques qui brisaient la résistance dans des accessions portant les allèles de résistance rymv1-3 et rymv1-5 en plus de rymv1-2. Les résultats de cette étude ont montré que les isolats de RYMV en Ouganda peuvent briser la résistance conférée par l’allèle du gène de résistance rymv1-2. Cependant, les accessions Tog5681 et Tog5674 semblent détenir une résistance stable au RYMV et sont donc recommandées pour la sélection du RYMV.

Mots Clés
Accession; brisure; bassin versant; Oryza sativa; résistance

 
 en Occurrence of rice yellow mottle virus resistance breaking isolates in lowland catchment zones of Uganda
Ramathani, I.; Mukasa, S.B.; Alicai, T.; Nanyiti, S. & Lamo, J.

Abstract

Rice ( Oryza check for this species in other resources spp; 2n=24.) production in Uganda and Africa in general, is seriously threatened by the Rice yellow mottle virus disease (RYMVD), a disease caused by Rice yellow mottle virus (RYMV) within the genus Sobemovirus; family Sobemoviridae. This study investigated the existence and distribution of resistance-breaking RYMV pathotype in the three major lowland rice catchment areas in Uganda. Four known rice accessions resistant to Rice yellow mottle virus (RYMV) namely; Gigante, Tog5672, Tog5674 and Tog5681, carrying resistant allele’s rymv1-2, rymv1-4 & RYMV3, rymv1-5 and rymv1-3, respectively, were tested for their response to different RYMV isolates. The isolates were collected from three major lowland rice catchment areas of Doho, Kibimba, and Olweny in Uganda. Out of 100 leaf samples collected from the field and assayed for RYMV and confirmed to be positive using RT-PCR, 83 isolates induced symptoms on IR64- the RYMV susceptible line. Seventy-seven (92.8%) isolates were able to overcome resistance in at least one of the four differential rice accessions, as confirmed by the presence of RYMV symptoms; while 6 (7.2%) isolates were asymptomatic. Variation in time (days) for symptom development post-inoculation (dpi) and AUDPC were observed. Symptoms appeared within 5-7 days on IR64; while it took on average 11, 18, 36, and 18 days to appear on Gigante, Tog5672, Tog5674 and Tog5681, respectively. The highest AUDPC was observed on IR64 (254.7); while the lowest was observed on Tog5681 (74.1). Two major patho-groups were observed; those that broke down resistance in Gigante only (25.3%) and Gigante & Tog5672 (33.7%). Five isolates from Doho (Budaka & Bugiri districts) and Kibimba (Butaleja district) catchment areas broke down RYMV resistance in three accessions i.e. (Tog5681, Gigante & Tog5672) and (Tog5674, Gigante & Tog5672), respectively. Resistance breaking isolates were confirmed in all  the three sampled catchment zones, however, Doho and Kibimba had some unique isolates that broke down resistance in accessions carrying resistance allele rymv 1-3 and rymv1-5 in addition to rymv1-2. Results from this study showed that RYMV isolates in Uganda can break down resistance conferred by the rymv1-2 resistance gene allele. However, accessions Tog5681 and Tog5674 seem to hold stable RYMV resistance and, thus are recommended for RYMV breeding.

Keywords
Accession; breakdown; catchment; Oryza sativa; resistance

 
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