Introducción: La clasificación a nivel de especies de las levaduras del género Candida de origen clínico es fundamental para el diagnóstico y la instauración de un adecuado tratamiento para el paciente. Se realizó un estudio de concordancia de cinco metodologías usadas para la identificación de aislamientos orales de Candida spp en Colombia.
Métodos: Sesenta y siete aislamientos de Candida spp fueron identificados a nivel de especie utilizando; API^® 20 C AUX, Vitek^® 2 Compact, MALDI TOF (Vitek^® MS y Microflex^®) y una prueba molecular, PCR Panfungal y secuenciación. Un análisis del costo comercial y tiempo de procesamiento de las muestras por cada método fue realizado mediante el análisis gráfico de ambas variables.
Resultados: La PCR Panfungal y secuenciación diferenció 12 especies de Candida, los métodos Vitek^® MS y Microflex^® identificaron 9 especies y los métodos API^® 20 C AUX y Vitek^® 2 Compact identificaron 8 especies. El análisis de Kappa ponderado (wK) demostró una concordancia alta entre los métodos PCR Panfungal y secuenciación, Vitek^® MS, Microflex^® y API^® 20 C AUX, concordancias agrupadas en las categorías buena y muy buena (wK 0.62-0.93); los Kp que involucraron el método Vitek^® 2 Compact presentaron concordancias moderadas o buenas frente a los otros métodos (wK 0.56-0.73). Las metodologías basadas en MALDI TOF MS requirieron 4 minutos para generar un resultado y el método Microflex^® fue el método que en nuestro medio presentó el menor precio de venta del servicio.
Conclusión: Los métodos evaluados presentaron una alta concordancia en sus resultados, siendo más alta para los métodos moleculares y las metodologías basadas en MALDI TOF MS; estas últimas son metodologías más rápidas, económicas y precisas, las cuales se presentan como alternativas prometedoras para la identificación rutinaria de especies de levaduras del género Candida.

Palabras-clave
Candida; mucosa bucal; diagnóstico; reacción en cadena de la polimerasa; espectrometría; masas; matrix asistida por láser de desorciónionización; Colombia