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ROTAVIRUS GASTROENTERITIS SURVEILLANCE AND PREVALENCE ASSESSMENT AMONG UNDER FIVE CHILDREN IN RWANDA Uwimana, J.; Ndishimye, P.; Bizimana, E.; Byiringiro, J. & Mutesa, L. Résumé Rotavirus reste la cause la plus fréquente de diarrhée sévère de l’enfance dans le monde et de mortalité par diarrhée dans les pays en développement. Malgré les efforts déployés par le gouvernement du Rwanda et les partenaires pour réduire la mortalité infantile, la prévalence de gastro-entérite à rotavirus au Rwanda reste à déterminer. Nous avons mené une étude transversale en milieu hospitalier qui visait à déterminer la prévalence de l’infection à rotavirus chez les enfants de moins de cinq présentant une gastro-entérite dans huit hôpitaux au Rwanda. De Juin 2013 à Août 2014, nous avons prélevé et examiné des échantillons de selles pour recherche de rotavirus en utilisant la technique d’immuno-enzymatique et la PCR en temps réel pour le génotypage. Dans 969 échantillons de selles collectés, 232 (23,94%) étaient positifs à rotavirus. Parmi eux, 119 ont été génotypés. La prévalence la plus élevée a été observée en Juillet (4,3% et 5,1%), tandis que la plus basse a été observée en Mars (0,00%). L’Hôpital de Muhima montrait une prévalence élevée (33,33%), tandis que les hôpitaux de Kabgayi et Rwamagana avaient la plus faible (15,62 et 18,18%, respectivement). Les enfants de sexe masculin étaient plus touchés que ceux de sexe féminin (25,8 contre 21,5%). Nous avons constaté que la prévalence était plus élevée (31,10%) chez les enfants âgés entre 12 et 24 mois. Pour le génotypage, G9 [P8] était le génotype le plus répandu dont la prévalence était de 54,6%, tandis que celle du [P8] était de 73,9%. En conclusion, la prévalence de la gastro-entérite à rotavirus était élevée chez les enfants âgés de moins de 5 ans, et il était différent selon les groupes d’âge et entre les différents hôpitaux au Rwanda. Mots Clés rotavirus; prévalence; gastroentérite; génotypage

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ROTAVIRUS GASTROENTERITIS SURVEILLANCE AND PREVALENCE ASSESSMENT AMONG UNDER FIVE CHILDREN IN RWANDA Uwimana, J.; Ndishimye, P.; Bizimana, E.; Byiringiro, J. & Mutesa, L. Abstract Rotavirus remains the most common cause of severe childhood diarrhea worldwide and of diarrheal mortality in developing countries. Despite the efforts made by the government of Rwanda and the stakeholders to reduce children mortality, the prevalence of rotavirus among under five children in Rwanda remains to be determined. We conducted a hospital-based cross-sectional study that aimed at determining the prevalence of rotavirus infection in under fie children presenting with gastroenteritis in eight hospitals in Rwanda. From June 2013 and August 2014 we collected and tested stool samples for the presence of rotavirus using an enzyme immunoassay and a Real Time-Polymerase Chain Reaction for genotyping. In 969 stool samples, 232 (23.94%) were rotavirus positive. Among them, 119 were genotyped. The highest prevalence was observed in July (4.3% and 5.1%) while the lowest one was observed in March (0.00%). Muhima Hospital had the highest prevalence (33.33%) whereas Kabgayi and Rwamagana Hospitals had the lowest (15.62 and 18.18%, respectively). Male children were more affected than females (25.8 versus 21.5%). We found that the prevalence was higher (31.10%) in children aged between 12 and 24 months than in other age groups. For genotyping, G9 [P8] was the most prevalent genotype as G9 prevalence was 54.6% whereas [P8] prevalence was 73.9%. In conclusion, the prevalence of rotavirus gastroenteritis was high among children aged less than 5 years, and it was different according to age groups and among different hospitals. Keywords Rotavirus; prevalence; gastroenteritis; genotyping

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