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African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730
EISSN: 1021-9730
Vol. 27, No. 2, 2019, pp. 253-265
Bioline Code: cs19018
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

African Crop Science Journal, Vol. 27, No. 2, 2019, pp. 253-265

 en Karyotype studies on ten genotypes of onion grown in Jos Plateau, Nigeria
Sirajo, S.A. & Namo, O.A.T.

Abstract

The large number of inter- and intra-specific differences in the genus Allium check for this species in other resources has necessitated karyotype analysis of the cultivated species, in order to describe patterns and directions of chromosomal evolution, which affects morphological differences. In this study, ten genotypes of onion ( Allium cepa check for this species in other resources L.) (Ares, Violet de Galmi, Red Creole, “Wase”, “Dan Zaria”, “Dan Garko”, “Dan Giyawa”, “Bahaushe”, “Bakana” and “Yar Aleiro”) were used for karyotype analysis in the Cytogenetics Laboratory of the University of Jos, Nigeria. Fresh root tips (1-1.5 cm long) obtained from each genotype were prepared and stained with aceto-orcein for 12 minutes. Each stained root tip was placed in a drop of water on a slide, covered with a coverslip and squashed. Each prepared slide was mounted on the microscope to observe the different stages of mitotic division. The results showed that the arm ratio, centromeric index, coefficient of variation, total form and disparity index varied with genotypes. Metacentric, sub-metacentric and sub-telocentric chromosomes were also observed. Based on a dendrogram of the phylogenetic relationships, the genotypes were grouped into four clusters. Cluster I comprised of genotypes Ares, “Wase” and “Bakana”. Cluster II comprised of genotypes “Dan Garko”, Violet de Galmi and “Dan Giyawa”. Cluster III consisted of the genotypes Red Creole, “Bahaushe” and “Dan Zaria”, while Cluster IV comprised of genotype “Yar Aliero”. The principal component analysis revealed that the centromere position and variation in complement length accounted for 92.71% of the total variations among the genotypes. These attributes could be responsible for the differences in fresh bulb size and dry matter yield of onion.

Keywords
Allium cepa; chromosome; metacentric; phylogenetic

 
 fr
Sirajo, S.A. & Namo, O.A.T.

Résumé

Le grand nombre de différences inter et intraspécifiques dans le genre Allium check for this species in other resources a nécessité une analyse caryotypique des espèces cultivées pour décrire les modèles et les directions de l’évolution chromosomique, ce qui affecte les différences morphologiques. Dans cette étude, dix génotypes d’oignon ( Allium cepa check for this species in other resources L.) (Ares, Violet de Galmi, Créole rouge, «Wase», «Dan Zaria», «Dan Garko», «Dan Giyawa», «Bahaushe», «Bakana» et «Yar Aleiro») ont été utilisés pour l’analyse du caryotype au laboratoire de cytogénétique de l’Université de Jos, au Nigéria. Des extrémités de racines fraîches (de 1 à 1,5 cm de long) obtenues à partir de chaque génotype ont été préparées et tachées à l’acéto-orcéine pendant 12 minutes. Chaque extrémité de racine tachée a été placée dans une goutte d’eau sur une lame, recouverte d’une lamelle couvre-objet et écrasée. Chaque lame préparée a été placée sur le microscope pour observer les différentes étapes de la division mitotique. Les résultats ont montré que le ratio des bras, l’indice centromérique, le coefficient de variation, la forme totale et l’indice de disparité variaient selon les génotypes. Des chromosomes métacentriques, sous-métacentriques et sub-télocentriques ont été observés. Le dendrogramme des relations phylogénétiques a montré que les génotypes étaient regroupés en quatre groupes. Le groupe I comprend les génotypes Ares, «Wase» et «Bakana». Le groupe II comprend les génotypes «Dan Garko», Violet de Galmi et «Dan Giyawa». Le groupe III était constitué des génotypes Red Creole, «Bahaushe» et «Dan Zaria», tandis que le groupe IV était constitué du génotype «Yar Aliero». L’analyse en composantes principales a révélé que la position du centromère et la variation de la longueur du complément représentaient 92,71% du total des variations parmi les génotypes. Ces caractéristiques pourraient être responsables des différences de taille des bulbes frais et de rendement en matière sèche de l’oignon.

Mots Clés
Allium cepa; chromosome; métacentrique; phylogénétique

 
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