Biotecnología Aplicada 1998;15:227-231
PCC2, A new transposon-like element In the white rot
fungus Phanerochaete chrysosporium
Bianca García, Manuel Raíces, Julio
Delgado, Göran
Pettersson
Code Number: BA98036
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ABSTRACT
The gene encoding cellobiose dehydrogenase
from
Phanerochaete chrysosporium K3 was isolated through PCR and
its 3045 bp
nucleotide sequence determined. Two distinct 5' flanking sequences
were identified by
Southern blot hybridization, both having a common 650 bp region,
but one of them
interrupted by a 2657 bp transposon-like element located at 425 bp
upstream from the initial
ATG. This element, named Pcc2, carried 14 bp inverted
terminal repeats while lacking
the conserved transposase motif it is flanked by a 2 bp (GT) target
duplication site and is
present at a high copy number throughout the P.
chrysosporium K3 genome.
Keywords: cellobiose dehydrogenase (CDH), gene,
Phanerochaete
chrysosporium, transposon-like element
RESUMEN
El gen codificante de la celobiosa
deshidrogenasa de
Phanerochaete chrysosporium K3 fue aislado mediante PCR y se
determinó la
secuencia nucleotídica de sus 3045 pb. Mediante
hibridación por Southern blot
se identificaron dos regiones 5' no codificantes diferentes, ambas
contenían una
región común de 650 pb, pero una de ellas estaba
interrumpida por una
secuencia de 2657 pb con características similares a un
transposón. Este
elemento, que se denominó Pcc2, está
localizado a 425 pb del ATG de
iniciación y contenía una secuencia de 14 pb repetida
e invertida, sin embargo
carecía del motivo conservado de las transposasas. El
elemento está
flanqueado por un sitio blanco de duplicación de 2 pb (GT) y
está presente en
un alto número de copias en el genoma de P.
chrysosporium K3.
Palabras claves: celobiosa deshidrogenasa (CDH), gen,
Phanerochaete
chrysosporium, transposón
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