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Biotecnologia Aplicada
Elfos Scientiae
ISSN: 0684-4551
Vol. 15, No. 4, 1998
Bioline Code: ba98036
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

Biotecnologia Aplicada, Vol. 15, No. 4, 1998

 en PCC2, A new transposon-like element in the white rot fungus Phanerochaete chrysosporium

Abstract

Biotecnología Aplicada 1998;15:227-231

PCC2, A new transposon-like element In the white rot fungus Phanerochaete chrysosporium

Bianca García, Manuel Raíces, Julio Delgado, Göran Pettersson

Code Number: BA98036
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ABSTRACT

The gene encoding cellobiose dehydrogenase from Phanerochaete chrysosporium K3 was isolated through PCR and its 3045 bp nucleotide sequence determined. Two distinct 5' flanking sequences were identified by Southern blot hybridization, both having a common 650 bp region, but one of them interrupted by a 2657 bp transposon-like element located at 425 bp upstream from the initial ATG. This element, named Pcc2, carried 14 bp inverted terminal repeats while lacking the conserved transposase motif it is flanked by a 2 bp (GT) target duplication site and is present at a high copy number throughout the P. chrysosporium K3 genome.

Keywords: cellobiose dehydrogenase (CDH), gene, Phanerochaete chrysosporium, transposon-like element

RESUMEN

El gen codificante de la celobiosa deshidrogenasa de Phanerochaete chrysosporium K3 fue aislado mediante PCR y se determinó la secuencia nucleotídica de sus 3045 pb. Mediante hibridación por Southern blot se identificaron dos regiones 5' no codificantes diferentes, ambas contenían una región común de 650 pb, pero una de ellas estaba interrumpida por una secuencia de 2657 pb con características similares a un transposón. Este elemento, que se denominó Pcc2, está localizado a 425 pb del ATG de iniciación y contenía una secuencia de 14 pb repetida e invertida, sin embargo carecía del motivo conservado de las transposasas. El elemento está flanqueado por un sitio blanco de duplicación de 2 pb (GT) y está presente en un alto número de copias en el genoma de P. chrysosporium K3.

Palabras claves: celobiosa deshidrogenasa (CDH), gen, Phanerochaete chrysosporium, transposón

Copyright 1998 Elfos Scientiae

 

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