search
for
 About Bioline  All Journals  Testimonials  Membership  News  Donations


African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730
EISSN: 2072-6589
Vol. 17, No. 2, 2009, pp. 71-86
Bioline Code: cs09007
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

African Crop Science Journal, Vol. 17, No. 2, 2009, pp. 71-86

 fr
Bucheyeki, Tulole Lugendo; Gwanama, C.; Mgonja, M.; Chisi, M.; Folkertsma, R. & Mutegi, R.

Résumé

Les marqueurs morphologiques et moléculaires ont été utilisés pour étudier la variabilité génétique de 40 variétés locales du sorgho collectées en Tanzanie et 2 en Zambie. Au total 14 promoteurs pour les marqueurs morphologiques et 7 pour les marqueurs microsatellites ou SSRs (simple sequence repeats) ont été utilisés pour (1) déterminer les rapports génétiques des variétés (2) évaluer les traits à importance agronomique. Cinq composantes principales correspondaient à 73.6% du total de variabilité. Des corrélations linéaires positives ont été trouvées entre les le rendement et la largeur de l'inflorescence (r=0.343*) ; Cinq moyennes de panicules et le rendement parcellaires (r=0.531*) ; et la sénescence des feuilles et la longueur de l'inflorescence (0.355*). Une corrélation négative a été enregistrée entre le nombre de talles et la longueur de l'inflorescence (r=0.343*). L'analyse cluster basée sur des traits morphologiques a révélé 3 groupes distinctifs majeurs avec une variété locale formant un cluster indépendant. En se basant sur les marqueurs moléculaires, onze clusters été observes. Les varietes témoins, N13, Ochuti et Adiwo chacune formaient des clusters indépendants. Les marqueurs Xgap84 and Xtxp320 avaient des allèles plus élevés que les autres marqueurs, avec respectivement, sept et 8 allèles. Les marqueurs moléculaires ont sépare clairement les varietes parmi et dans les groups distinctifs que mieux les marqueurs morphologiques. Il n'y avait pas de marqueurs phénotypiques spécifiques à l'exception des témoins Ochuti et N13. L'information générée par cette étude peut être utilisée par des sélectionneurs pour l'amélioration du sorgho.

Mots Clés
Variété, Sorghum bicolor, SSRs, Zambie

 
 en Genetic variability characterisation of Tanzania sorghum landraces based on simple sequence repeats (SSRs) molecular and morphological markers
Bucheyeki, Tulole Lugendo; Gwanama, C.; Mgonja, M.; Chisi, M.; Folkertsma, R. & Mutegi, R.

Abstract

Morphological and molecular markers were employed to study the genetic variability among 40 sorghum landraces collected from Tanzania and two from Zambia. A total of 14 morphological markers and seven simple sequence repeats (SSRs) primers were used to (i) determine the genetic relationships among landraces, and (ii) assess important agronomic traits. Five principal components accounted for 73.60% of the total variability. There were positive significant correlation between yield and inflorescence width (r = 0.343*), five panicles averages and plot yields (r = 0. 531*), leaf senescence and inflorescence length (r = 0.355*). Negative significant correlation between tiller numbers and inflorescence length (r = -0.343*) was recorded. Cluster analysis based on morphological traits revealed three major distinct groups with one landrace forming independent cluster. Based on molecular markers, eleven clusters were observed. Sorghum controls, N13, Ochuti and Adiwo each formed independent clusters. Markers Xgap84 and Xtxp320 had high alleles than other markers. These had seven and eight alleles respectively. Molecular markers clearly separated landraces within and between groups than morphological markers. There were no genotype specific makers with the exceptions of Ochuti and N13 controls.

Keywords
Landraces, Sorghum bicolor, SSRs, Zambia

 
© Copyright 2009 - African Crop Science Society

Home Faq Resources Email Bioline
© Bioline International, 1989 - 2022, Site last up-dated on 19-Jan-2022.
Site created and maintained by the Reference Center on Environmental Information, CRIA, Brazil
System hosted by the Internet Data Center of Rede Nacional de Ensino e Pesquisa, RNP, Brazil