|
African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730 EISSN: 1021-9730
Vol. 17, No. 2, 2009, pp. 71-86
|
Bioline Code: cs09007
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge
|
|
African Crop Science Journal, Vol. 17, No. 2, 2009, pp. 71-86
fr |
Bucheyeki, Tulole Lugendo; Gwanama, C.; Mgonja, M.; Chisi, M.; Folkertsma, R. & Mutegi, R.
Résumé
Les marqueurs morphologiques et moléculaires ont été utilisés pour étudier la variabilité génétique de 40 variétés
locales du sorgho collectées en Tanzanie et 2 en Zambie. Au total 14 promoteurs pour les marqueurs morphologiques
et 7 pour les marqueurs microsatellites ou SSRs (simple sequence repeats) ont été utilisés pour (1) déterminer
les rapports génétiques des variétés (2) évaluer les traits à importance agronomique. Cinq composantes principales
correspondaient à 73.6% du total de variabilité. Des corrélations linéaires positives ont été trouvées entre les le
rendement et la largeur de l'inflorescence (r=0.343*) ; Cinq moyennes de panicules et le rendement parcellaires
(r=0.531*) ; et la sénescence des feuilles et la longueur de l'inflorescence (0.355*). Une corrélation négative a été
enregistrée entre le nombre de talles et la longueur de l'inflorescence (r=0.343*). L'analyse cluster basée sur des
traits morphologiques a révélé 3 groupes distinctifs majeurs avec une variété locale formant un cluster indépendant.
En se basant sur les marqueurs moléculaires, onze clusters été observes. Les varietes témoins, N13, Ochuti et
Adiwo chacune formaient des clusters indépendants. Les marqueurs Xgap84 and Xtxp320 avaient des allèles
plus élevés que les autres marqueurs, avec respectivement, sept et 8 allèles. Les marqueurs moléculaires ont
sépare clairement les varietes parmi et dans les groups distinctifs que mieux les marqueurs morphologiques. Il n'y avait pas de marqueurs phénotypiques spécifiques à l'exception des témoins Ochuti et N13. L'information
générée par cette étude peut être utilisée par des sélectionneurs pour l'amélioration du sorgho.
Mots Clés
Variété, Sorghum bicolor, SSRs, Zambie
|
|
en |
Genetic variability characterisation of Tanzania sorghum landraces based on simple sequence repeats (SSRs) molecular and morphological markers
Bucheyeki, Tulole Lugendo; Gwanama, C.; Mgonja, M.; Chisi, M.; Folkertsma, R. & Mutegi, R.
Abstract
Morphological and molecular markers were employed to study the genetic variability among 40 sorghum landraces
collected from Tanzania and two from Zambia. A total of 14 morphological markers and seven simple sequence
repeats (SSRs) primers were used to (i) determine the genetic relationships among landraces, and (ii) assess
important agronomic traits. Five principal components accounted for 73.60% of the total variability. There were
positive significant correlation between yield and inflorescence width (r = 0.343*), five panicles averages and plot
yields (r = 0. 531*), leaf senescence and inflorescence length (r = 0.355*). Negative significant correlation
between tiller numbers and inflorescence length (r = -0.343*) was recorded. Cluster analysis based on morphological
traits revealed three major distinct groups with one landrace forming independent cluster. Based on
molecular markers, eleven clusters were observed. Sorghum controls, N13, Ochuti and Adiwo each formed
independent clusters. Markers Xgap84 and Xtxp320 had high alleles than other markers. These had seven and
eight alleles respectively. Molecular markers clearly separated landraces within and between groups than morphological
markers. There were no genotype specific makers with the exceptions of Ochuti and N13 controls.
Keywords
Landraces, Sorghum bicolor, SSRs, Zambia
|
|
© Copyright 2009 - African Crop Science Society
|
|