search
for
 About Bioline  All Journals  Testimonials  Membership  News  Donations


African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730
EISSN: 2072-6589
Vol. 19, No. 4, 2011, pp. 357-367
Bioline Code: cs11033
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

African Crop Science Journal, Vol. 19, No. 4, 2011, pp. 357-367

 en Characterisation of bacterial brown spot pathogen from dry bean production areas of South Africa
Muedi, H.T.H.; Fourie, D. & Mclaren, N.W.

Abstract

Pseudomonas syringae pv. syringae check for this species in other resources (Pss) causes bacterial brown spot (BBS) of beans ( Phaseolus vulgaris check for this species in other resources L.), with yield losses of up to 55% in South Africa. Pss has a wide host range and for many of these, the pathogen has been biochemically and genetically characterised. However, few studies have been conducted on Pss isolated from beans. The aim of this study was to assess the biochemical and genetic variability of Pss isolates collected from dry bean producing areas in South Africa. Pure isolates were subjected to LOPAT tests and SyrB gene assessment. Biolog GN Microplates were used to assess carbon substrate utilisation. The SyrB gene was present in 42% of isolates. The Biolog GN Microplates showed biochemical variation among isolates. Variable genomic patterns were observed in 48.5% by the BOX A1R primer and in 37.1% of isolates by the ERIC 2 primer. Thus, variability exists in Pss populations of dry beans.

Keywords
Phaseolus vulgaris, Pseudomonas syringae, SyrB gene

 
 fr
Muedi, H.T.H.; Fourie, D. & Mclaren, N.W.

Résumé

Pseudomonas syringae pv. syringae check for this species in other resources (Pss) cause de la maladie de tâche bactérinne brune (BBS) de haricot ( Phaseolus vulgaris check for this species in other resources L.), et des pertes de rendement allant jusqu’à 55% en Afrique du Sud. Pss possède une large gamme d’hôtes et pour la plupart d’entr’eux, le pathogène a été biochimiquement et génétiquement caractérisé. Cependant, peu d’études ont été conduites sur le Pss isolé du haricot. L’objet de cette étude était d’évaluer la variabilité biochimique et génétique des isolats de Pss collectés des milieux producteurs de haricot sec en Afrique du Sud. Des isolats pures étaient soumis aux tests LOPAT et évaluation du gène SyrB. Les microplats Biolog GN étaient utilisés pour évaluer l’utilisation du substrat de carbone. Le gène SyrB était présent dans 42% des isolats. Les microplats Biolog GN ont montré une variation biochemique parmi les isolats. De modèles génomiques variables étaient observés dans 48.5% par le BOX A1R primer et dans 37.1% des isolats par le ERIC 2 primer. Ainsi, il exite une variabilité dans les populations de Pss de haricot sec.

Mots Clés
Phaseolus vulgaris, Pseudomonas syringae, gène SyrB

 
© Copyright 2011 - African Crop Science Society

Home Faq Resources Email Bioline
© Bioline International, 1989 - 2019, Site last up-dated on 17-Apr-2019.
Site created and maintained by the Reference Center on Environmental Information, CRIA, Brazil
System hosted by the Internet Data Center of Rede Nacional de Ensino e Pesquisa, RNP, Brazil